عتبر القطاع الخيري بمثابة القلب النابض المنوط به تنفيذ الأعمال الخيرية التي تقدمها إدارة الأوقاف؛ إذ يخصّص لها ميزانية سنوية للصرف على المشاريع الخيرية داخل المملكة العربية السعودية أو خارجها، وذلك بالتعاون مع الوزارات والمؤسسات الحكومية والجمعيات والمؤسسات الخيرية المعتمدة والعاملة في نفس المجال، ويقوم القطاع الخيري بعمل الآليات المناسبة لمساعدة الجهات المتقدمة لها مراعية في ذلك الهدف الأسمى وهو أن يصل الدعم سواء أكان دعماً مالياً أم عينياً إلى مستحقيه مباشرة، وتنحصر نوعية الأعمال الخيرية المقدمة وفقاً للمصارف الخيرية التي حدّدها الموقف (رحمه الله) بصك الوقفية.